MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 129174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015422	ATGCG	2	10	111138	111147	20 %	20 %	40 %	20 %	330822754
3002	NC_015422	CAG	2	6	111169	111174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822754
3003	NC_015422	GCC	2	6	111181	111186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822754
3004	NC_015422	CG	3	6	111213	111218	0 %	0 %	50 %	50 %	330822754
3005	NC_015422	CTGGT	2	10	111266	111275	0 %	40 %	40 %	20 %	330822754
3006	NC_015422	GCG	2	6	111294	111299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822754
3007	NC_015422	TGCA	2	8	111311	111318	25 %	25 %	25 %	25 %	330822754
3008	NC_015422	CGT	2	6	111348	111353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822754
3009	NC_015422	CAC	2	6	111469	111474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822754
3010	NC_015422	CGGC	2	8	111485	111492	0 %	0 %	50 %	50 %	330822754
3011	NC_015422	GC	3	6	111524	111529	0 %	0 %	50 %	50 %	330822754
3012	NC_015422	GTT	2	6	111550	111555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822754
3013	NC_015422	CTTC	2	8	111570	111577	0 %	50 %	0 %	50 %	330822754
3014	NC_015422	CTT	2	6	111673	111678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822754
3015	NC_015422	GCT	2	6	111699	111704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822754
3016	NC_015422	TCC	2	6	111722	111727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822754
3017	NC_015422	GGC	2	6	111751	111756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822754
3018	NC_015422	GGC	2	6	111769	111774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822754
3019	NC_015422	GGCG	2	8	111798	111805	0 %	0 %	75 %	25 %	330822754
3020	NC_015422	CAG	2	6	112229	112234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822755
3021	NC_015422	CGG	2	6	112255	112260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822755
3022	NC_015422	CAC	2	6	112265	112270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822755
3023	NC_015422	CAC	2	6	112283	112288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822755
3024	NC_015422	GCC	2	6	112314	112319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822755
3025	NC_015422	CGG	2	6	112327	112332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822755
3026	NC_015422	GCG	2	6	112478	112483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822756
3027	NC_015422	GCT	2	6	112488	112493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3028	NC_015422	CTG	2	6	112501	112506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3029	NC_015422	CG	3	6	112521	112526	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3030	NC_015422	GCA	2	6	112530	112535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3031	NC_015422	CAG	2	6	112564	112569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3032	NC_015422	GC	3	6	112577	112582	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3033	NC_015422	TGG	2	6	112583	112588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822756
3034	NC_015422	GC	3	6	112636	112641	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3035	NC_015422	CG	4	8	112659	112666	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3036	NC_015422	GC	3	6	112678	112683	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3037	NC_015422	ATG	2	6	112715	112720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822756
3038	NC_015422	CAG	2	6	112726	112731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3039	NC_015422	GCC	2	6	112747	112752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822756
3040	NC_015422	CTT	2	6	112771	112776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822756
3041	NC_015422	GGCC	2	8	112815	112822	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3042	NC_015422	GCGCCC	2	12	112823	112834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822756
3043	NC_015422	TCT	2	6	112845	112850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822756
3044	NC_015422	CAG	2	6	112858	112863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3045	NC_015422	CCT	2	6	112890	112895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822756
3046	NC_015422	CAG	3	9	112900	112908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3047	NC_015422	GTC	2	6	112909	112914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3048	NC_015422	GGCG	2	8	112920	112927	0 %	0 %	75 %	25 %	330822756
3049	NC_015422	CG	3	6	112935	112940	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3050	NC_015422	TGC	2	6	113000	113005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3051	NC_015422	GC	3	6	113038	113043	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3052	NC_015422	GC	4	8	113081	113088	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3053	NC_015422	CAG	2	6	113107	113112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3054	NC_015422	GCC	4	12	113113	113124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822756
3055	NC_015422	GAC	2	6	113131	113136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3056	NC_015422	CCAGCG	2	12	113172	113183	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330822756
3057	NC_015422	CGG	2	6	113193	113198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822756
3058	NC_015422	TCG	3	9	113207	113215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3059	NC_015422	CTG	2	6	113239	113244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3060	NC_015422	TCC	2	6	113276	113281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822756
3061	NC_015422	GCA	2	6	113295	113300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3062	NC_015422	CG	3	6	113319	113324	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3063	NC_015422	CG	3	6	113371	113376	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3064	NC_015422	ACG	2	6	113438	113443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822756
3065	NC_015422	CTC	2	6	113455	113460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822756
3066	NC_015422	TTG	2	6	113480	113485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822756
3067	NC_015422	GC	3	6	113547	113552	0 %	0 %	50 %	50 %	330822756
3068	NC_015422	GGCG	2	8	113613	113620	0 %	0 %	75 %	25 %	330822756
3069	NC_015422	GCG	3	9	113618	113626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822756
3070	NC_015422	TGGA	2	8	113639	113646	25 %	25 %	50 %	0 %	330822756
3071	NC_015422	TGG	2	6	113652	113657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822756
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3073	NC_015422	CGTCCA	2	12	113784	113795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330822757
3074	NC_015422	CG	3	6	113799	113804	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3075	NC_015422	CGC	2	6	113832	113837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822757
3076	NC_015422	GGCG	2	8	113878	113885	0 %	0 %	75 %	25 %	330822757
3077	NC_015422	GC	4	8	113889	113896	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3078	NC_015422	GCAG	2	8	113898	113905	25 %	0 %	50 %	25 %	330822757
3079	NC_015422	CAG	2	6	113977	113982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822757
3080	NC_015422	GCG	3	9	114002	114010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822757
3081	NC_015422	GCG	2	6	114029	114034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822757
3082	NC_015422	CAG	2	6	114049	114054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822757
3083	NC_015422	GCGG	2	8	114058	114065	0 %	0 %	75 %	25 %	330822757
3084	NC_015422	GC	3	6	114086	114091	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3085	NC_015422	TCC	2	6	114176	114181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822757
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3087	NC_015422	GC	3	6	114233	114238	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3088	NC_015422	GGC	2	6	114256	114261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822757
3089	NC_015422	GC	3	6	114272	114277	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3090	NC_015422	GTCGCC	2	12	114298	114309	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	330822757
3091	NC_015422	CAG	2	6	114340	114345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822757
3092	NC_015422	GC	3	6	114389	114394	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3093	NC_015422	GCT	2	6	114402	114407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822757
3094	NC_015422	TGGCGC	2	12	114431	114442	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330822757
3095	NC_015422	GGC	2	6	114481	114486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822757
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3098	NC_015422	CGC	2	6	114597	114602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822757
3099	NC_015422	TGC	2	6	114609	114614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822757
3100	NC_015422	GCC	2	6	114706	114711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822757
3101	NC_015422	CG	3	6	114720	114725	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3102	NC_015422	GCG	2	6	114750	114755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822757
3103	NC_015422	GAA	2	6	114760	114765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822757
3104	NC_015422	GCA	2	6	114780	114785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822757
3105	NC_015422	CGC	3	9	114792	114800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822757
3106	NC_015422	GCCC	2	8	114801	114808	0 %	0 %	25 %	75 %	330822757
3107	NC_015422	GGT	2	6	114829	114834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822757
3108	NC_015422	GC	3	6	114839	114844	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3109	NC_015422	GCC	2	6	114853	114858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822757
3110	NC_015422	CATGCC	2	12	114871	114882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330822757
3111	NC_015422	CG	4	8	114918	114925	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3112	NC_015422	GCA	2	6	114984	114989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822757
3113	NC_015422	GGC	2	6	114997	115002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822757
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3115	NC_015422	GGC	2	6	115072	115077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822757
3116	NC_015422	CG	4	8	115087	115094	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3117	NC_015422	GGCT	2	8	115106	115113	0 %	25 %	50 %	25 %	330822757
3118	NC_015422	GCC	2	6	115185	115190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822757
3119	NC_015422	CG	3	6	115191	115196	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3120	NC_015422	GC	3	6	115270	115275	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3121	NC_015422	GCGGG	2	10	115292	115301	0 %	0 %	80 %	20 %	330822757
3122	NC_015422	GC	3	6	115318	115323	0 %	0 %	50 %	50 %	330822757
3123	NC_015422	GTCGTA	2	12	115360	115371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330822757
3124	NC_015422	TGG	2	6	115397	115402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822757
3125	NC_015422	GTCCA	2	10	115406	115415	20 %	20 %	20 %	40 %	330822757
3126	NC_015422	GCC	2	6	115489	115494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822758
3127	NC_015422	GCA	2	6	115549	115554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822758
3128	NC_015422	GCG	2	6	115567	115572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822758
3129	NC_015422	AGT	2	6	115591	115596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822758
3130	NC_015422	ATG	2	6	115635	115640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822758
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3134	NC_015422	CAG	2	6	115733	115738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822758
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3144	NC_015422	GCA	2	6	115990	115995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822758
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3151	NC_015422	CG	3	6	116216	116221	0 %	0 %	50 %	50 %	330822758
3152	NC_015422	CGT	2	6	116233	116238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822758
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3229	NC_015422	CG	5	10	119008	119017	0 %	0 %	50 %	50 %	330822759
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3234	NC_015422	CTC	2	6	119242	119247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822759
3235	NC_015422	GCT	2	6	119325	119330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822759
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3237	NC_015422	CGCC	2	8	119495	119502	0 %	0 %	25 %	75 %	330822760
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3239	NC_015422	GC	3	6	119574	119579	0 %	0 %	50 %	50 %	330822760
3240	NC_015422	GC	3	6	119608	119613	0 %	0 %	50 %	50 %	330822760
3241	NC_015422	GGCG	2	8	119643	119650	0 %	0 %	75 %	25 %	330822760
3242	NC_015422	CG	4	8	119657	119664	0 %	0 %	50 %	50 %	330822760
3243	NC_015422	GGCA	2	8	119737	119744	25 %	0 %	50 %	25 %	330822760
3244	NC_015422	CCG	2	6	119759	119764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822760
3245	NC_015422	CGGC	2	8	119769	119776	0 %	0 %	50 %	50 %	330822760
3246	NC_015422	CGG	2	6	119787	119792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822760
3247	NC_015422	CGG	3	9	119795	119803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822760
3248	NC_015422	TGA	2	6	119807	119812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822760
3249	NC_015422	GCA	2	6	119834	119839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822760
3250	NC_015422	GGA	2	6	119859	119864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822760
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3252	NC_015422	GC	3	6	119911	119916	0 %	0 %	50 %	50 %	330822760
3253	NC_015422	GC	4	8	119995	120002	0 %	0 %	50 %	50 %	330822760
3254	NC_015422	CG	4	8	120012	120019	0 %	0 %	50 %	50 %	330822760
3255	NC_015422	TCC	3	9	120121	120129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822760
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3257	NC_015422	CG	3	6	120183	120188	0 %	0 %	50 %	50 %	330822760
3258	NC_015422	ATG	2	6	120253	120258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822760
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3260	NC_015422	GCC	2	6	120516	120521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822761
3261	NC_015422	GC	3	6	120535	120540	0 %	0 %	50 %	50 %	330822761
3262	NC_015422	GGC	2	6	120579	120584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822761
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3265	NC_015422	GGC	2	6	120716	120721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822761
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3269	NC_015422	GGCCCA	2	12	120773	120784	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330822761
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3273	NC_015422	TGGT	2	8	120904	120911	0 %	50 %	50 %	0 %	330822761
3274	NC_015422	TGC	2	6	120959	120964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822761
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3281	NC_015422	CAGC	2	8	121209	121216	25 %	0 %	25 %	50 %	330822761
3282	NC_015422	CTT	2	6	121218	121223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822761
3283	NC_015422	TCG	2	6	121228	121233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822761
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3290	NC_015422	AGT	2	6	121463	121468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822761
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3294	NC_015422	AGC	2	6	121596	121601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822762
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3314	NC_015422	CAG	2	6	122478	122483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822763
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3316	NC_015422	CTTGGC	2	12	122658	122669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822763
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3322	NC_015422	GCCG	2	8	122787	122794	0 %	0 %	50 %	50 %	330822763
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3345	NC_015422	TCG	2	6	123735	123740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822764
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3350	NC_015422	CAG	2	6	123989	123994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822764
3351	NC_015422	TGG	2	6	124032	124037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822764
3352	NC_015422	CCA	2	6	124038	124043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822764
3353	NC_015422	TCG	2	6	124083	124088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822764
3354	NC_015422	CTA	2	6	124120	124125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822764
3355	NC_015422	GCCG	2	8	124142	124149	0 %	0 %	50 %	50 %	330822764
3356	NC_015422	CCG	2	6	124161	124166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822764
3357	NC_015422	GTG	2	6	124196	124201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822764
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3362	NC_015422	GCT	2	6	124318	124323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822764
3363	NC_015422	C	6	6	124379	124384	0 %	0 %	0 %	100 %	330822764
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3365	NC_015422	CAT	2	6	124477	124482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822764
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3486	NC_015422	GC	3	6	128873	128878	0 %	0 %	50 %	50 %	330822768
3487	NC_015422	CGC	2	6	128894	128899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822768
3488	NC_015422	AGCG	2	8	128907	128914	25 %	0 %	50 %	25 %	330822768
3489	NC_015422	GAA	2	6	128942	128947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822768
3490	NC_015422	TCC	2	6	128967	128972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822768
3491	NC_015422	GCC	2	6	128997	129002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822768
3492	NC_015422	GCCG	2	8	129014	129021	0 %	0 %	50 %	50 %	330822768
3493	NC_015422	TCG	2	6	129030	129035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822768
3494	NC_015422	CGCC	2	8	129049	129056	0 %	0 %	25 %	75 %	330822768
3495	NC_015422	CCT	2	6	129118	129123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330822768
3496	NC_015422	CTGC	2	8	129151	129158	0 %	25 %	25 %	50 %	330822768
3497	NC_015422	CAGG	2	8	129215	129222	25 %	0 %	50 %	25 %	330822768
3498	NC_015422	GCC	2	6	129237	129242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822768
3499	NC_015422	CCA	2	6	129244	129249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822768
3500	NC_015422	GCC	2	6	129328	129333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822768

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